История фармацевтического образования в Украине ведет начало с 1805 года: на кафедре врачебного веществословия, фармации и врачебной словесности Харьковского Императорского университета началась подготовка аптекарей.
Национальный фармацевтический университет прошел величественный эволюционный путь развития:
1812 - на фармацевтическом отделении медицинского факультета Харьковского Императорского университета - организована первая фармацевтическая лаборатория.
1921 - основан Харьковский фармацевтический институт  первый в Украине фармацевтический вуз.

1992 - реорганизация ХФИ в Украинскую фармацевтическую академию.
1999 - получен статус Национальной фармацевтической академии Украины.
2002 - реорганизация в Национальный фармацевтический университет.

        Национальный фармацевтический университет (НФаУ) - ведущее высшее фармацевтическое учебное заведение Украины, история которого ведет начало из учреждения в 1805 году при Императорском Харьковском университете на медицинском факультете первой фармацевтической лаборатории. По инициативе группы ученых, профессоров Н.А.Валяшко, М.П.Красовского, А.Д.Розенфельда приказом Наркомосу УССР от 10 сентября 1921 года в Харькове был основан фармацевтический институт. Первым ректором его стал выдающийся ученый профессор Н.А.Валяшко. В разные времена фармацевтический институт возглавляли профессора: Ю.Г.Борисюк, Г.П.Пивненко, Д.П.Сало.
        С 1980 года НФаУ возглавляет доктор фармацевтических наук, доктор химических наук, член-корреспондент Национальной академии наук Украины, заслуженный деятель науки и техники Украины, заслуженный изобретатель Украины, лауреат Государственной премии Украины, полный кавалер ордена "За заслуги", кавалер ордена Ярослава Мудрого V степени, профессор Валентин Петрович Черных. Благодаря усилиям коллектива и инициативы ректора В.П.Черных Харьковский фармацевтический институт в 1992 году получил статус Украинской фармацевтической академии, в 1999 году - Национальной фармацевтической академии Украины, в 2002 году - Национального фармацевтического университета (НФаУ). По инициативе НФаУ был основан профессиональный праздник "День фармацевтического работника Украины" и почетное звание "Заслуженный работник фармации Украины".
        Сегодня НФаУ - это современное европейское высшее учебное заведение ІV уровня аккредитации, который отметил в 2005 году славный  юбилей 200-летия основания. фармацевтического образования в Украине и 200-летия со дня учреждения.
        Университет имеет развитую материально-техническую базу общей площадью 105000 кв.м., которая отвечает требованиям мировых стандартов качества образования: 6 учебных корпусов и 5 общежитий. В структуре НФаУ: 10 факультетов, 49 кафедр, в том числе военная, Институт повышения квалификации специалистов фармации (ИПКСФ), колледж НФаУ, 4 учебно-научно-производственных комплекса, научно-методическая лаборатория по вопросам фармацевтического образования МОЗ Украины, Государственная научно-исследовательская лаборатория из контроля качества лечебных средств, Центральная научно-исследовательская лаборатория, клинико-диагностический центр, проблемная лаборатория морфофункциональных исследований, наставительно-научная техническая лаборатория врачебных форм, лаборатория клинической диагностики, научно-исследовательская лаборатория микробиологических та иммунологических исследований, компьютерный и издательский центры, современный физкультурно-оздоровительный комплекс, центр косметологии и аромологии, библиотека, пищевой комплекс и структурные подразделения, которые подчинены МОЗ Украины и МОН Украины: Республиканская Проблемная комиссия "Фармация" МОЗ и АМН Украины, Научно-методическая комиссия по фармации МОН Украины, Клиническая база Государственного фармакологического центра МОЗ Украины, Северо-восточное региональное отделение Государственного фармакологического центра МОЗ Украины.
Контингент студентов, аспирантов, магистрантов, слушателей ИПКСФ составляет более чем 17 тысяч человек. Учебный процесс в университете обеспечивают почти 800 преподавателей, среди них: 84 доктора наук, профессора; 400 кандидатов наук, доцентов; 1 член-корреспондент НАН Украины; 14 академиков отраслевых Академий наук Украины; 16 заслуженных деятелей науки и техники Украины. За выдающийся вклад в развитие фармацевтического образования и науки Украины коллектив в 2005 году награжден Почетной грамотой Кабинета Министров Украины.
        Подготовка специалистов в университете проводится за специальностями: "Фармация", "Клиническая фармация", "Технология парфюмерно-косметических средств", "Лабораторная диагностика", "Технология фармацевтических препаратов", "Экобиотехнология", "Промышленная биотехнология", "Биотехнология БАР", "Экономика предприятия", "Маркетинг", "Менеджмент организаций". Также в НФаУ предоставляется возможность получить второе высшее образование по специальностям: "Качество, стандартизация и сертификация", "Педагогика высшей школы", "Административный менеджмент".
        За время существования НФаУ подготовил свыше 40000 специалистов и почти 5000 магистров фармации для 80 стран мира.
        Выпускники НФаУ работают в аптеках, фармацевтических фирмах, аптечных базах, контрольно-аналитических лабораториях, филиалах аптек, аптечных пунктах, на фармацевтических заводах и фабриках, начальниками аптек военных частей и медицинских учреждений силовых министерств и ведомств Украины, в лечебно-профилактических закладах, бюро судейско-медицинской экспертизы, в учреждениях по реализации медицинской техники та экспертами таможенной службы контроля.
        Национальный фармацевтический университет - один из ведущих научно-исследовательских центров в области фармации. Сегодня научные исследования в университете проводятся по направлениям: синтез и анализ биологически активных веществ и выявление связи "структура - действие"; поиск и создания новых лекарственных средств естественного происхождения; разработка состава и технологий получения новых лекарственных форм, создание безотходных, экологически чистых технологий; разработка гомеопатических и парфюмерно-косметических средств; проведение фармакологических исследований биологически активных веществ и лекарственных средств; разработка новых методов анализа лекарственных средств для оперативного выявления фальсифицированной продукции; исследование в области менеджмента и маркетинга в фармации и педагогики и психологии высшей школы. Усилия ученых университета направлены, прежде всего, на создание новых врачебных препаратов. Сегодня НФаУ имеет значительные наработки в этом направлении: проводится полный комплекс научно-исследовательских работ по созданию лекарственных средств. Свыше 30 лекарственных препаратов в разных лекарственных формах введено в медицинскую практику. На разных этапах внедрения находятся свыше 100 врачебных препаратов, из которых: медицинское применение - 9, клинические испытания - 22, доклиническое изучение - 75.
        Изобретения ученых университета защищены свыше 350 патентами и 700 авторскими свидетельствами.
При Национальном фармацевтическом университете функционируют магистратура, аспирантура, докторантура и два специализированных ученых совета:

• Д 64.605.01 созданная приказом ВАК Украины № 555 от 24.09.2007 г., срок полномочий от 01.10.2007 г. до 01.10.2010  г., проводит защиту докторских и кандидатских диссертаций на получение научной степени кандидата и доктора фармацевтических наук по двум научным специальностям:
• 15.00.02 - "Фармацевтическая химия и фармакогнозия";
• 14.03.05 - "Фармакология";
• Д 64.605.02 созданная приказом ВАК Украины № 554 от 24.09.2007 г., срок полномочий от 01.10.2007 г. до 01.10.2010  г., проводит защита докторских и кандидатских диссертаций на получение научной степени кандидата и доктора фармацевтических наук за научной специальностью
• 15.00.01 - "Технология лекарства и организация фармацевтического дела".

        Подготовка кандидатов и докторов наук проводится в НФаУ с 1937 года. За это время подготовлено 103 докторов наук и 643 кандидатов наук.
        Ученые НФаУ плодотворно работают над созданием учебно-методических и научных изданий. В научное наследие ученых университета входит около 20 тысяч научных работ. За последние 15 лет выданы издательством НФаУ: 90 учебников, 464 учебных пособия, 32 монографии и 426 методических рекомендаций. Учебниками и учебными пособиями, которые подготовили преподаватели НФаУ, пользуются несколько поколений студентов всех фармацевтических учебных заведений Украины и стран СНГ и многих высших учебных заведений другого профиля (Киево-Могилянская академия, Харьковский национальный университет им. В.Н.Каразіна и др.). Неоднократно учебная литература НФаУ отмечалась наградами, в том числе и Государственной премией Украины.
        В университете издаются научные журналы: "Вестник фармации", "Клиническая фармация", "Журнал органической и фармацевтической химии", "Фармацевтическая газета" (совместно с Тернопольским государственным медицинским университетом им. И.Я. Горбачевского), научно-практический журнал "Косметология и аромология", которые являются профессиональными изданиями ВАК Украины, "Управление, экономика и обеспечения качества в фармации", "Украинский биофармацевтический журнал" (совместно с частным предприятием "Фармитек").